Głównymi bohaterami w grze są:

Mroczni Bohaterowie:

Mroczni Bohaterowie są osobami (postaciami zarówno pozytywnymi jak i negatywnymi) oszukanymi lub najętymi przez siedmiu niecnych arcybiesów. Posiadają niezwykłą siłę, czasami jest ona jednak czasami nadawana kosztem utraty pamięci oraz są to generałowie kościulców w Patapon 3. Jest 7 Mrocznych Herosów, czyli tyle samo co Arcybiesów. Każdy Mroczny Bohater należy do jednego arcybiesa:

1. Złokieł Wściekłowilk - Arcybies Męstwa
2. Nęciłuska - Arcybies Czystości
3. Nietaktoperz Sonarcha - Arcybies Sprawiedliwości
4. Krukolec - Arcybies Uczciwości
5. Żarcioczułek - Arcybies Powściągliwości
6. Leniożółw- Arcybies Nieugiętości
7. Śliskoszept- Arcybies Tolerancji

Wszystkich Mrocznych Herosów przed siedzibą ich Arcybiesa pokonujemy na arenie. Na każdej z nich gromadzi się grupa Herosów. Na początku gry pojawia się tylko Wściekłowilk, a już pod koniec na Arenie Tolerancji spotkamy ich aż czterech. Obowiązuje u nich zasada: maksymalnie czterech Bohaterów na jedną arenę. I tak z resztą niekiedy jeden z nich jest nie przygotoway dno bitwy.

Srebrny Hoshipon:
Srebrny Hoshipon to postać pojawiająca się w grze "Patapon 3"
Występuje tylko w trzeciej części gry. Gdy Arcybiesy przemieniły Patapony w kamień, Srebrny Hoshipon wydostał się z zakazanego naczynia i uratował Patapony przyzywając Wszechmogącego i ożywiając  przy pomocy Bohatera skremowanych szczątków wybranego przez nas bohatera, zmieniając go w Uberhero (Almighty i Wakapona w jednym). Uratował Również China, Tona, Kana przy pomocy duszy patapońskich bohaterów . Jest to Hoshipon o białych wąsach, srebrno - błękitnym wyglądzie i charakterystycznym dla Hoshiponów okiem. Pod koniec gry okazuje się, że Srebrny Hoshipon jest czymś czego szuka całe plemie pataponów. Było obiecane Pataponom na Końcu Świata . Aż do końca gry Patapon 3  nie wiedziały czym tak na prawdę jest "To". W zakończeniach gier Patapon oraz Patapon 2 odnajdujemy fałszywe To (W pierwszej części jest to poranne słońce, natomiast w drugiej Wielkie Jajo w Środku Świata i Księżniczka Pataponów), jednak na początku trzeciej części gry odnajdujemy prawdziwe To, jakim jest Srebny Hoshipon . . Prowadzi także swój własny sklep. Sprzedaje ta między innymi Motywy i Fryzury dla naszego Uberhero, które możemy nabyć za gwiezdne okruch